Les couleurs noir et rouge sont utilisées par les anarchistes depuis au moins la fin des années 1800, bien que généralement utilisées par les anarcho-communistes. Le drapeau a été utilisé comme symbole des anarcho-syndicalistes par la CNT pendant la guerre civile espagnole. Le noir représente l'anarchisme et le rouge représente les idéaux de gauche et socialistes. George Woodcock écrit que le drapeau noir et rouge coupé en deux symbolisait l'union de "l'esprit de l'anarchisme ultérieur avec l'appel de masse de la Première Internationale".

Le logo Antifa à deux drapeaux est inspiré du logo original de l'Antifaschistische Aktion, une organisation antifasciste militante en Allemagne qui a existé de 1932 à 1933. Il reste un symbole largement utilisé de l'antifascisme militant. Le drapeau noir représente l'anarchisme et le drapeau rouge représente les communistes, tous deux unis contre le fascisme.